V rámci skupiny kvalifikovaných certifikátov sú vydávané aj tzv. kvalifikované mandátne certifikáty pre elektronický podpis, v ktorých sú uvádzané informácie o mandatárovi a tiež o pridelenom rozsahu oprávnení na konanie, ktoré má udelené držiteľ certifikátu a o mandantovi, tj. o subjekte, ktorý tento mandát udelil a v mene ktorého mandatár koná.

Formát kvalifikovaného mandátneho certifikátu je špecifikovaný v dokumente NBU SR.

Kvalifikované mandátne certifikáty sú využívané všade tam, kde v rámci vytvoreného podpisu dokumentu je dôležité mať k dispozícii informácie o rozsahu oprávnenia podpisujúcej osoby v prípade, že je tento rozsah oprávnení (mandát) špecificky ohraničený typom mandátu.

Zoznam oprávnení, pre ktoré je možné vystaviť kvalifikovaný mandátny certifikát je špecifikovaný v dokumente NBU SR.